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中国农业银行POS机的手续费是按每次刷卡金额的5%收费的。中国农业银行相关规定：

1、千手认证交易双方、续费防止支付欺诈。多少能够使用数字签名和数字证书等实现对网上商务各方的银行认证，以防止支付欺诈，费率对参与网上贸易的标准各方身份的有效性进行认证，通过认证机构或注册机构向参与各方发放数字证书，农行农业以证实其身份的千手合法性。

2、续费加密信息流。多少可以采用单密钥体制或双密钥体制进行信息的银行加密和解密，可以采用数字信封、费率数字签名等技术加强数据传输的标准保密性与完整性，防止未被授权的农行农业第三者获取信息的真正含义。

3、数字摘要算法确认支付电子信息的真伪。为了保护数据不被未授权者建立、嵌入、删除、篡改、重放等，完整无缺地到达接收者一方，可以采用数据杂凑技术。

4、保证交易行为和业务的不可抵赖性。当网上交易双方出现纠纷，特别是有关支付结算的纠纷时，系统能够保证对相关行为或业务的不可否认性。网络支付系统必须在交易的过程中生成或提供足够充分的证据来迅速辨别纠纷中的是非，可以用数字签名等技术来实现。

5、处理网络贸易业务的多边支付问题。支付结算牵涉客户、商家和银行等多方，传送的购货信息与支付指令信息还必须连接在一起，因为商家只有确认了某些支付信息后才会继续交易，银行也只有确认支付才会提供支付。为了保证安全，商家不能读取客户的支付指令，银行不能读取商家的购货信息，这种多边支付的关系能够借用系统提供的诸如双重数字签名等技术来实现。

6、提高支付效率。网络支付的手续和过程并不复杂，支付效率很高。因此中国农业银行POS机的手续费是按每次刷卡金额的5%收费的。

如果是销售，农行pos机刷卡手续费按银联标准是1%，如果是批发，农行POS机刷卡手续费**可以封顶，比如：20封顶、30封顶。意思是手续费**为20、30。

不同性质的商户，农行pos机刷卡时商家承担的手续费比例是不同的，这个主要看当时跟POS提供单位的签约情况来确定，通常是按照比例扣。

农业银行pos机手续费情况如下：

（1）标准商户类：借记卡刷pos机手续费，是刷卡金额的0.5%，20封顶。

信用卡刷pos机手续费，是刷卡金额的0.5%。

（2）优惠商户类：借记卡刷pos机手续费，是刷卡金额的0.38%，13封顶。信用卡刷pos机手续费，是刷卡金额的0.38%。农行的pos机的手续费是根据银行联业的标准在1%左右。